Der BGA wendet sich gegen verpflichtende Kennzeichnungsvorhaben, die für Verbraucher keinen Mehrwert bringen, die Herstellung der Ware aber unwirtschaftlich machen. So wird beispielsweise für verarbeitetes Fleisch vielfach eine verpflichtende genaue Herkunftskennzeichnung gefordert. Dies würde jedoch die Herstellung etwa von Hackfleisch oder Wurstwaren erheblich verteuern, da hierbei Fleisch von Tieren aus verschiedenen Ländern zum Einsatz kommt. Zudem ändern sich bei diesen Produkten die Warenströme je nach Bedarf und Verfügbarkeit, so dass die Informationen regelmäßig kostspielig angepasst werden müssten. Unter Verbraucherschutzaspekten ist maßgeblich, welches Fleisch ein Produkt enthält, nicht aber zwingend, woher es kommt. Zusätzliche Pflichten bei der Herkunftskennzeichnung stünden darüber hinaus im Widerspruch zum Gedanken eines einheitlichen europäischen Binnenmarktes. Erhebungen der Europäischen Kommission zeigen, dass die Verbraucher zwar an entsprechenden Informationen interessiert, aber nicht bereit sind, hierfür höhere Preise zu zahlen.

Je nach Herkunft des Ausgangsmaterials birgt der Einsatz der neuen Düngemittel die Gefahr, dass neben Schwermetallen (z.B. Blei, Chrom, Cadmium, Nickel, Quecksilber usw.) auch eine Kontamination mit organischen Schadstoffen und pharmazeutisch wirksamen Substanzen vorliegen kann. Gerade bei Siedlungsabfällen wie Klärschlamm oder Bioabfallkompost kann nicht ausgeschlossen werden, dass Reste von Haushaltschemikalien, Arzneimitteln oder hormonell wirkenden Substanzen das Düngemittel belasten und durch die Ausbringung in das Ökosystem Acker und schließlich in den Nahrungskreislauf des Menschen gelangen. Daher regt der BGA zulässige Höchstwerte für Schwermetalle in allen Düngemitteln an. Darüber hinaus sollten für aus organischen Reststoffen gewonnene Düngemittel auch zulässige Grenzwerte für Antibiotika, Arzneimittel, pharmazeutisch wirksame Substanzen und organische Schadstoffe festgelegt werden. Weiter setzt sich der BGA dafür ein, dass durch die neue Verordnung ausgeschlossen wird, dass Böden durch makroskopische Verunreinigungen verschmutzt werden.